基于转录组测序的SSR位点在不同倍性白姜花株系多态性分析

摘要：

研究姜花二倍体形成四倍体过程中与mRNA对应的DNA序列上的SSR是否发生变异,为探索四倍体白姜花性状发生变化可能的遗传机制奠定基础.在前期转录组测序基础上,统计SSR位点,设计特异SSR引物,提取二倍体和四倍体白姜花的叶片DNA进行PCR扩增和测序,分析比较SSR位点在两者之间的差异.结果表明:10个SSR位点核心序列为(AG)n,7个SSR位点在四倍体和二倍体上基因型一致,未发生变异;3个杂合位点基因型尚不能判断.同时,在3个SSR位点筛选出A＞C或者A＞G的SNP,而且在四倍体和二倍体姜花植株中相同.

关键词： 白姜花株系 多态性分析 SSR位点 转录组测序

作者: 张爱玲 涂红艳 吴泳薇 林雅柔 吴思彤 莫水秀 钟春晖 蔡瑜佳 丘妙莹 肖望

作者单位: 广东第二师范学院生物与食品工程学院广东高校应用生态工程技术开发中心,广州510303

会议类型: 国内会议

会议名称: 2018年中国观赏园艺学术研讨会

会议地点: 哈尔滨

会议语种:中文

页码: 525-529

在线出版日期: 2018-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）