姜花HcTPS12和HcTPS16的克隆与功能信息学分析
以白姜花(Hedychium coronarium)为材料,利用RT-PCR技术克隆得到两个倍半萜合成酶基因,分别命名为HcTPS12和HcTPS16.HcTPS12的最大ORF长1653bp,编码550个氨基酸(aa),预测分子量为64.2kDa,等电点(pI)为4.97.HcTPS16的最大ORF长1641bp,编码546个氨基酸(aa),预测分子量为64.3kDa,等电点(pI)为5.30.蛋白家族结构域分析显示HcTPS12和HcTPS16均含有两个保守序列,N端结构域萜类合成酶家族及C末端活性结构域萜类合成酶家族C.氨基酸同源序列比对结果显示,HcTPS12和HcTPS16分别与多条倍半萜合成酶基因的同源性较高.聚类分析进化树结果表明结果显示HcTPS12和HcTPS16都属于被子植物倍半萜合成酶家族TPSa.亚细胞定位及信号肽分析显示HcTPS12和HcTPS16均不存在信号肽,且HcTPS12和HcTPS16均可能定位于胞质.蛋白疏水性预测分析结果表明HcTPS12和HcTPS16均有较强的亲水性.二级结构预测分析结果显示HcTPS12含有69.45％的α-螺旋、6.18％的延伸链和24.36％的无规则卷曲;HcTPS16含有71.79％的α-螺旋、6.23％的延伸链和21.98％的无规则卷曲(ran-dom coil),α-螺旋是它们的二级结构中最主要的结构形式.此外,三级结构预测分析结果显示HcTPS12和HcTPS16的三级结构具有很高的同源性.
姜花 HcTPS16基因 HcTPS12基因 基因克隆 功能信息学
熊美新 岳跃冲 李昕悦 范燕萍
华南农业大学林学与风景园林学院,华南农业大学花卉研究中心,广州510642
国内会议
哈尔滨
中文
549-558
2018-07-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）