用RNA深度测序和核糖体印记法同时系统分析EV71感染后宿主和病毒的基因表达
肠道病毒71型为单正链RNA病毒,属小RNA病毒科肠道病毒属,感染低龄儿童会引起手足口病,严重的可能引起系列神经系统病症甚至致死。小RNA病毒在进入宿主之后迅速引起宿主基因表达关闭,病毒基因利用特有的内部核糖体进入位点保持翻译。本研究利用RNASeq和Ribosome Profiling技术分析了EV71感染横纹肌肉瘤细胞后不同时间病毒和细胞基因的mRNA及核糖体保护RNA片段,观察病毒和宿主基因组表达的动态变化。这种技术基于高通量测序,可在全细胞水平同时监测mRNA及核糖体保护RNA片段。其中RNA保护片段作为活跃翻译的标志,能够使我们高分辨率的了解从转录后到翻译之间的精细调控。
肠道病毒感染 病理机制 基因表达 RNA深度测序 核糖体印记法
林永权 戴爱梅 王岩 陈宇航 谈娟 谢志 Zhilong Yang 乔文涛
分子微生物学与技术重点实验室(教育部)和微生物功能基因组学重点实验室(天津市),生命科学学院,南开大学,天津300071 眼科学国家重点实验室,眼科学与视觉科学重点实验室(广东省),中山大学,广州510060 Division of Biology,Kansas State University,Manhattan,Kansas,USA,66503
国内会议
长春
中文
66-66
2017-08-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)