茯苓菌落褐变的转录组测序分析
完成茯苓正常与褐变菌丝体共4个样品的转录组测序,共获得25.61Gb Clean Data,各样品Clean Data均达到5.84Gb,Q30碱基百分比在89.81％及以上.分别将各样品的Clean Reads与指定的参考基因组进行序列比对,比对效率从38.09％到68.04％不等,共鉴定到12383个基因.基于比对结果,进行可变剪接预测分析、基因结构优化分析以及新基因的发掘,发掘新基因1,017个,其中260个得到功能注释.基于比对结果进行基因表达量分析,根据基因在不同样品中的表达量识别差异表达基因,发现正常菌落与三个不同程度褐变菌落有336个共同差异基因,并对其进行功能注释和富集分析.
茯苓 菌落褐变 转录组测序 差异表达基因
蔡丹凤 蔡志欣 林衍铨 陈美元
福建省农业科学院食用菌研究所,特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福州350014
国内会议
福建省科协第十六届学术年会分会暨2016年福建省食用菌学会学术年会
福州
中文
44-50
2016-08-20（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）