甘蔗SoNIN1基因结构及其内含子信息分析

摘要：

根据前期克隆得到的SoNIN1基因的全长cDNA和部分启动子序列设计引物,应用PCR技术从甘蔗叶片gDNA中克隆SoNIN1基因,并利用生物信息学方法分析基因的结构.结果表明,SoNIN1基因的DNA序列长4938bp,包含6个外显子和5个内含子,GenBank登录号KF563902.在该基因5”非翻译区存在一个268bp内含子序列,同时5个内含子序列中含有与低温、干旱和激素等胁迫响应相关的作用元件,这些可能对SoNIN1基因转录表达起调控作用.依据SoNIN1蛋白聚类和外显子-内含子基因结构可以将植物NINs分为两类.

关键词： 甘蔗 SoNIN1基因 转化酶 生物信息学

作者: 牛俊奇 吴朝兴 杨丽涛 李杨瑞

作者单位: 广西大学农学院 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530005 广西大学农学院 亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁 530005;中国农业科学院甘蔗研究中心 广西农业科学院甘 蔗研究所 农业部广西甘蔗生物技术与遗传改良重点实验室 广西甘蔗遗传改良重点

会议类型: 国内会议

会议名称: 广西甘蔗学会第十届代表大会暨2015年学术交流会

会议地点: 广西来宾

会议语种:中文

页码: 1,148-152

在线出版日期: 2015-09-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）