会议专题

河南省濮阳市7株肠道病毒71型全基因组序列分析

目的:了解濮阳地区手足口病患者标本中分离的肠道病毒71型(EV71)病毒全基因组特征. 方法:选取市辖区内部分手足口病肠道病毒EV71型核酸阳性标本,使用RD(human rhabdomyosarcom人横纹肌肉瘤)细胞进行病毒培养,RT-PCR型别鉴定,对分离得到的7株EV71型毒株通过12对引物进行分段扩增,扩增产物进行EV71型全基因组序列测定和基因进化特性分析,利用生物信息学软件对序列进行分析并构建EV71病毒在濮阳地区的分类和发育图谱. 结果:对7株EV71病毒进行系统发育树构建,7株EV71病毒在分类上均属于C4亚型C4a分支.在发育相似度上主要分为两大类,其中的PY464与宁波2010年的NINGBO.CHN/065/2010EV71分离株相似度最高,而其他6株呈现聚类,与山东临沂的EV71SDLY107分离株相似度最高.在同一时期、同一地区,轻重症病例分离到的毒株VP1区段没有差别,而全基因区段存在一定的差别,这些位置的变异很可能是导致轻重症病例的关键. 结论:在同一地区,手足口病毒在同一时期亦呈现出某一种病毒为主的流行趋势.

手足口病 流行特征 肠道病毒71型 全基因测序 基因进化

徐国锋 王瑞 张清杰 张玉华 孟晓飞 隋美丽 李懿 卫海燕 黄学勇

濮阳市疾病预防控制中心,河南濮阳457000 郑州大学公共卫生学院,河南郑州 450001 河南省疾病预防控制中心,河南郑州450016

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2016-06-15(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)