肺癌早期诊断的潜在生物标志物LncRNA差异表达谱研究
(0) 目的：肺癌是世界范围内最致命的恶性肿瘤之一.早期检测的敏感、特异性的标志物是降低疾病的高发病率和高死亡率的必要途径,肿瘤特异性LncRNA是癌症早期诊断和治疗的潜在标志物. 方法：应用Affymetrix LncRNA表达谱芯片技术筛选肺癌组织和癌旁对照组织中差异表达的LncRNA,结合TCGA数据库中差异表达的LncRNA数据,进一步筛选出肺癌相关差异表达的LncRNA,并采用实时荧光定量PCR技术检测差异表达LncRNA在扩大样本人群中的表达情况,绘制肺癌相关LncRNA表达谱.根据候选LncRNA的表达水平,连锁分析LncRNA的异常表达与肺癌发病风险之间的关系.通过曲线下面积分析评估候选LncRNA在肺癌中的诊断价值. 结果：芯片表达谱分析结果显示,与癌旁对照组相比,肺癌组织中共筛选出392个差异表达的LncRNA,其中表达上调的有125个,表达下调的有267个.从TCGA数据库中共筛选出256个肺痛相关差异表达的LncRNA,其中有103个LncRNA表达下调,153个LncRNA表达上调.结合LncRNA表达谱芯数据及TCGA数据库,筛选6个(LHFPL3-AS2、SFTA1P、LINC00472、BRE-AS1、LINC0312、GVINP1)表达下调的交集LncRNA.实时荧光定量PCR结果确认2个(LINC00312、BRE-AS1)肺癌相关差异表达LncRNA与芯片结果一致,证实了芯片数据的可靠性.单因素和多因素logistic归分析发现,LINC00312和BRE-AS1低表达与肺癌发病风险增加显著相关,且LINC00312和BRE-AS1的异常表达增加了肺癌的发病风险.ROC曲线评估LINC00312和BRE-AS1诊断肺癌的AUC分别为0.784和0.916. 结论：发现了一组肺癌相关LncRNA差异表达谱,这些肺癌相关差异表达LncRNA可能是高危人群早期筛查及早期检测的潜在生物标志物.
肺癌 长链非编码核糖核酸 基因表达 诊断价值
张艳秋 隋静 申娴 李成云 姚文卓 洪伟伟 彭慧 浦跃朴 尹立红 梁戈玉
东南大学公共卫生学院,环境医学工程教育部重点实验室,江苏南京210009
国内会议
第十二届全国环境与职业医学研究生学术研讨会暨复旦大学博士生论坛公共卫生篇
上海
中文
380-387
2016-11-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）