GMA诱导的16HBE恶性转化细胞相关差异LncRNA筛选及其研究
目的:GMA结构与甲醛相似，属低毒类；可诱导多种哺乳动物细胞发生恶性转化，具有潜在致癌性。筛选GMA诱导的16HBE恶性转化细胞(第30代)相关差异表达LncRNA及其相关mRNA,探讨差异表达的LncRNA在GMA诱导的16HBE恶性转化细胞中的表达水平及意义. 方法:收获经8μg/mL GMA诱导的16HBE恶性转化第30代细胞及同代龄DMSO溶剂对照组细胞,应用高通量LncRNA芯片比较两组样本表达谱的差异,通过差异倍数、邻近编码基因信息分析等策略初步筛选出GMA诱导的16HBE恶性转化第30代细胞中差异表达LncRNA及其最可能的蛋白质编码基因(mRNA),采用实时荧光定量PCR(qPCR)和全基因组表达谱芯片分析差异表达LncRNA和mRNA的表达量,并与同代龄DMSO溶剂对照组细胞比较. 结果:LncRNA芯片结果显示,与DMSO组相比,GMA诱导的16HBE恶性转化第30代细胞中筛选出2664个差异表达的LncRNA及2216个差异表达LncRNA相关的mRNA;差异表达的LncRNA中PCA3、CTBP1-AS1和CDKN2B-AS1表达分别上调7.17、2.20和5.39倍,qPCR结果显示,PCA3、CTBP1-AS1表达量与芯片结果一致(P＜0.05),全基因组表达谱芯片显示PRUNE2下调,CTBP1上调,与LncRNA芯片结果一致. 结论:LncRNAPCA3、CTBP1-AS1可作为GMA诱导的16HBE恶性转化细胞中相关特异分子标志.
支气管肿瘤 恶性转化 长链非编码RNA 基因表达 甲基丙烯酸环氧丙酯
王全凯 谢广云 刘红梅 许建宁
中国疾病预防控制中心职业卫生与中毒控制所,北京100050;中国疾病预防控制中心化学污染与健康安全重点实验室,北京100050
国内会议
中国环境诱变剂学会风险评价专业委员会第六届换届大会暨第十八届全国学术交流会
湖北宜昌
中文
155-162
2016-08-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）