柿属植物叶绿体蛋白质编码基因密码子用法

摘要：

为给后续柿属植物叶绿体基因工程研究提供基础,利用codonW、CUSP、SPSS软件对5个柿属植物叶绿体基因组中的55条蛋白质编码基因序列进行密码子使用模式分析.结果显示,柿属植物叶绿体基因组密码子第3位碱基GC含量为26.9％～27.8％,有效密码子数在49.58～50.18之间,密码子偏好性较弱;柿叶绿体基因组不同位置的有效密码子数不同,取值范围为32.36～59.64;中性绘图分析和ENC-plot绘图分析结果表明,柿叶绿体基因组的密码子偏好性主要受选择的影响;通过高频密码子和高表达优越密码子分析相结合的方法,筛选出23个柿属植物最优密码子,且这些密码子主要以A和U碱基结尾.

关键词： 柿属植物 叶绿体 基因序列 密码子 使用偏好性

作者: 傅建敏 索玉静 刘慧敏 谭晓风

作者单位: 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙410004;国家林业局泡桐研究开发中心,河南郑州450003;中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州450003 国家林业局泡桐研究开发中心,河南郑州450003;中国林业科学研究院经济林研究开发中心,河南郑州450003 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室,湖南长沙410004

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国林学会经济林分会2016年学术年会

会议地点: 四川都江宴

会议语种:中文

页码: 38-44

在线出版日期: 2016-10-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）