转录组分析揭示lncRNA参与调控湖羊肌肉的生长发育
lncRNA作为非编码RNA分子的重要成员,其时空性表达可能通过改变基因的表达从而调控肌肉的生长发育,而绵羊肌肉lncRNA的研究严重滞后.为筛选湖羊肌肉生长发育相关的功能性lncRNA,利用二代测序分别构建湖羊胎儿、羔羊及成年羊的背最长肌lncRNA测序文库,分析并鉴定湖羊不同发育阶段肌肉lncRNA的特征,预测lncRNA靶基因,构建lncRNA-靶基因共表达调控网络,从而确定湖羊肌肉生长发育相关的lncRNA.本研究通过生物信息学所筛选的lncRNA靶基因与肌肉的生长发育紧密相关。RTL1基因已证实参与促进小鼠肌肉的增长,而且对绵羊肌肉肥大的调控作用显著,JPH2是调控心肌成熟的关键基因,进一步说明我们所筛选的lncRNA可能参与肌肉的生长发育。本研究预测了湖羊肌肉生长相关的lncRNA,拓展了绵羊肌肉lncRNA数据库,为绵羊肌肉生长的分子研究提供了新的候选调控因子,但这些lncRNA的调控作用仍需进一步研究。
湖羊 lnc核糖核酸 肌肉生长 基因调控 转录组分析
任才芳 杨花 邓明田 张艳丽 樊懿萱 王锋
南京农业大学,江苏省肉羊产业工程技术研究中心,江苏南京210095
国内会议
2017年全国养羊生产与学术研讨会暨养羊学分会第七次全国会员代表大会
石家庄
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2017-08-18(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)