miR-15b靶基因预测、信号通路分析及靶基因鉴定
目的：为初步探究miR-15b的生物学功能. 方法：利用TargetScan Release7.0,PicTar和PITA数据库对miR-15b靶基因进行预测,随后用DAVID数据库对预测出的靶基因集进行功能富集分析(Gene Ontology-analysis)及信号转导通路富集分析(KEGG Pathwayanalysis),并对其中的两个靶基因通过双萤光素酶报告系统进行了验证. 结果：三个软件共同预测出miR-15b的靶基因有305个,靶基因集合功能富集于蛋白激酶活性、GTP结合蛋白调控等分子功能,蛋白氨基酸磷酸化、细胞周期调控等生物学过程及微管相关复合体、转录因子复合体等细胞组分上.信号转导通路则显著富集于癌症相关信号通路.随后对预测出的能量代谢通路相关miR-15b靶基因丙酮酸脱氢酶激酶4(PDK4)和免疫相关功能靶基因CD28基因进行验证,实验结果显示CD28为miR-15b的靶基因,而PDK4不是miR-15b的靶基因. 结论：miR-15b可能会通过靶向CD28参与T细胞的免疫应答过程.
非编码单链RNA-15b 靶基因 信号通路 生物学功能
孙文阳 蓝静 陈磊 闫尊强 王金勇 滚双宝
重庆市畜牧科学院,重庆 荣昌 402460;甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃 兰州 730070 重庆市畜牧科学院,重庆 荣昌 402460 甘肃农业大学动物科学技术学院,甘肃 兰州 730070;甘肃省现代养猪工程技术研究中心,甘肃 兰州 730070
国内会议
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1407-1417
2016-05-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）