小麦赤霉菌基因组高变区专化于植物侵染和病菌适应
赤霉菌(Fusarium graminearum)引起的赤霉病，是小麦、大麦和玉米上最为严重的病害之一。到目前为止，高质量的基因组测序结果仅美国菌株PH-1一个。在本研究中，我们对中国小麦主产区的三个代表菌株进行了全基因组重测序。分析结果表明，所有测序菌株在序列和系统发育上彼此相距较远，中国菌株中每个菌株约有100个基因在功能上特异缺失。赤霉菌的变异位点分布不均，可分为两个亚基因组：包括一个高变的快速基因组和一个保守的慢速基因组。高变的快速基因组GC含量较低且基因长度较短，外显子数目变异较大。此外，该亚基因组中富集正选择基因、侵染上调基因和分泌蛋白基因。综上所述，我们的研究表明，赤霉菌存在两个不同变异速率的基因组且其快速基因组专化于植物侵染和病菌适应。根据上述研究，我们鉴定到了106个侵染相关基因。
小麦赤霉病 基因组变异 变异速率 正选择 RNA-seq 侵染相关基因
王秦虎 刘慧泉 王晨芳 许金荣
旱区作物逆境生物学国家重点实验室/西北农林科技大学植物保护学院,杨凌712100 旱区作物逆境生物学国家重点实验室/西北农林科技大学植物保护学院,杨凌712100;美国普度大学植物及植物病理系,印第安纳州IN 47907
国内会议
泰安
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87-87
2015-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）