辣椒溶杆菌(Lysobacter capsici)X2-3抗菌作用特点及全基因组序列分析
溶杆菌(Lysobacter)多分布于土壤和水体,是植物根围常见的PGPR类型之一.本实验室从小麦根际土壤中分离到菌株X2-3,经16S RNA基因序列分析,确定其为辣椒溶杆菌(Lysobacter capsici).抑菌测定发现,菌株X2-3对Rhizoctonia cerealis、Rhizoctonia solani、Bipolaris sorokiniana、Fusarium oxysporum f.sp.cucumerinum、Verticillium dahliae、Colletotrichum gloeosporioides、Pythium myriotylum、Botrytis cinerea、Botryosphaeria ribis、Valsa mali、Phytophthora parasitica var.nicotianae等多种植物病原真菌和卵菌及Bacillus sp.等革兰氏阳性细菌具有明显的拮抗作用,但对Ralstonia solanacearum没有作用.为了解X2-3中的抗菌物质及其合成基因,在Illumina MiSeq及Illumina HiSeq 2 500测序平台对X2-3基因组进行序列测定,在此基础上,使用SOAP denovo软件对所测序列的信息进行组装,并采用GeneMarkS软件进行基因预测分析,发现,X2-3的基因组总长为6 126 365 bp,组装后产生3个scaffolds,分为13个contigs,N50长度为699 639 bp.最长和最短的contig分别为1 781 518 bp和6 232 bp.对所预测的基因在NCBI中进行Blast分析发现,X2-3全基因组中含有5个非核糖体多肽合成酶基因簇,它们可能参与抗菌物质的生物合成,但这些基因的功能有待进一步实验验证.
辣椒溶杆菌(Lysobacter capsici) 抗菌作用 全基因组序列分析 非核糖体肽合成酶
衣静莉 王静 刘朝霞 张莉 刘爱新
山东农业大学植物保护学院,泰安271018
国内会议
泰安
中文
131-131
2015-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）