河北梨转录组高通量测序及分析
河北梨是特产于我国的野生濒危物种,已被列为我国极小种群之一.目前,河北梨的分子生物学研究较少,基因数据库资源极度缺乏.本文通过对河北4个混合样品的转录组测序及其抗性相关基因的表达分析,结果表明:转录组测序总共获得7.32GB数据,25877477个高质量reads,GC含量为47.69％,共拼接了448278条unigenes.Unigenes在各数据库中功能注释数目,在COG中有7505条,在GO中有18590条,在Swissprot中有19248条,在Nr中有26941条;在KEGG中有5104条,共定位到123个不同的代谢分支中.基于河北梨的抗性特征,我们初步探索利用转录组数据库研究抗性基因表达,分析转录组数据库中与植物病原菌互作反应、激素信号转导、谷胱甘肽代谢与抗坏血酸代谢等途径的相关基因,发掘河北梨抗性研究新领域.本研究对河北梨转录组的组装和功能注释获得了大量转录本信息,为河北梨的分子生物学研究提供了宝贵的基因数据来源.
河北梨 转录组 基因注释 抗性分子机制
梁婷婷 臧德奎
山东农业大学林学院,山东泰安,271018
国内会议
中国林学会树木学分会第十七届学术年会暨海峡两岸树木学教学研讨会
南京
中文
56-66
2015-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）