凡纳滨对虾微卫星标记的开发和应用
利用凡纳滨对虾的转录组测序数据中挖掘得到微卫星序列14,767条,微卫星出现的频率为16.76%;其中2碱基微卫星最多,占59.53%,其次是3碱基微卫星,占35.78%.选取其中74条序列设计引物,在96个个体中进行扩增,有54对引物(72.97%)得到了有效扩增,其中23对显示出多态性;选取7个多态性微卫星标记进行遗传多样性研究,获得的等位基因数目为3到6个不等,平均为4.6个,多态性信息含量0.518到0.737.本研究中获得的大量的微卫星标记,为后续使用微卫星标记进行对虾遗传学研究提供了重要基础,可以有助于对虾遗传多样性的了解,促进对虾的遗传选育和种质资源保护.
凡纳滨对虾 转录组测序 微卫星序列 遗传多样性
杨铭 于洋 张晓军 刘敬文 李富花 相建海
中国科学院海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室;福州市海洋与渔业技术中心 中国科学院海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室 中国科学院海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室;中国科学院大学
国内会议
福州
中文
163-167
2015-09-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)