麋鹿鹿茸转录组基因高通量测序分析
通过对麋鹿鹿茸表皮和间充质组织总RNA提取,采用高通量测序技术测序,构建麋鹿转录组框架图;利用NR和Swiss-Prot数据库对Unigenes进行比对等方法.结果发现:在NR数据库中27208个Unigenes(E value＜1e-5)得到了注释,在Swiss-Prot数据库中,共有24093个Unigenes得到了注释;将两个数据库的比对结果进行统计分析,Swiss-Prot数据库所注释的Unigenes在NR数据库中几乎同样获得了注释.利用GO对27209个Unigenes进行功能注释,其中22750个Unigenes具有分子功能.利用KEGG对57015个Unigenes进行代谢通路分析,结果显示仅有6604个Unigenes参与代谢,占Unigenes总数的11.58％.利用GO和KEGG数据库对这些差异表达Unigenes进行功能注释和代谢通路分析,发现绝大多数差异表达Unigenes均与角质细胞的生长发育有关.
麋鹿 鹿茸 转录组基因 高通量测序 功能注释 代谢通路
张树苗 张林源 梁兵宽 李坤 陈颀 李越 陈星
北京麋鹿生态实验中心,100076,北京 国家林业局调查规划设计院,北京100714 北京市理化分析测试中心,100089,北京
国内会议
北京
中文
172-177
2015-11-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）