基于线粒体COⅠ基因齿小蠹属Ips昆虫DNA条形码研究
齿小蠹属(鞘翅目:小蠹科)昆虫是植物检疫中经常截获的类群,为探讨线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(CoⅠ)基因的特定区段作为DNA条形码快速准确鉴定齿小蠹的可行性,以齿小蠹属昆虫为研究对象,采用磁珠法测定分析了线粒体CoⅠ基因462bp碱基序列.序列分析结果显示:变异位点为259个,保守位点203个,简约信息位点181个,自裔位点78个.所有位点中,A,G,C和T碱基平均含量分别为30.7％,16.5％,17.0％和35.8％;A+T含量较高为66.5％,明显高于G+C含量,表现明显的A+T碱基偏嗜,且A与T含量相当,符合昆虫线粒体基因碱基组成的基本特征.转换与颠换结果显示:该段序列未达到饱和,可以得到准确的进化分析.利用Kimura2-parameter模型分析遗传距离显示,同物种间的遗传距离介于0.002～0.007之间,不同种间的遗传距离介于0.056～0.431间,平均遗传距离为0.199,说明该段序列能够区分不同物种.基于CoⅠ基因序列构建的邻接法系统发育树(NJ树)显示,同一物种聚为同一小支,且分支自展值均为100％;近缘种能聚集在一起,且置信度很高(≥97％).说明CoⅠ基因片段作为齿小蠹属DNA条形码对其进行分类鉴定具有一定的可行性.
齿小蠹属昆虫 脱氧核糖核酸 条形码 C氧化酶亚基Ⅰ
常虹 郝德君 肖荣堂 刘勇 钱路 安榆林 杨晓军
南京林业大学 森林资源与环境学院 南京 210372 吴江出入境检验检疫局 江苏 吴江 215203 江苏出入境检验检疫局 南京 210001
国内会议
江苏扬州
中文
64-71
2012-09-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）