脑心肌炎病毒VP2基因编码蛋白的生物信息学分析及纳米PCR快速检测方法的建立
脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus，EMCV)可引起的猪、某些哺乳动物乃至灵长类动物以脑炎、心肌炎或心肌周围炎。本研究以脑心肌炎病毒(Encphalomyocarditis virus,EMCV) HB10株VP2基因为目的基因,建立EMCV快速诊断方法;并对VP2基因进行克隆、测序并用生物信息学技术分析EMCV-HB10-VP2蛋白的糖基化位点、磷酸化位点、信号肽、B细胞抗原表位及其二、三级结构.结果表明,成功克隆了EMCV-HB10-VP2基因;构建重组质粒pEGFP-HB10-VP2,并以此质粒作为阳性模板建立了特异性好、灵敏性高的EMCV快速诊断方法;生物信息学分析表明,EMCV-HB10-VP2蛋白可能存在4个糖基化位点;对磷酸化位点预测:丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸分别有:6个、7个、3个位点可能存在磷酸化;可能存在6个B细胞抗原表位;对EMCV-HB10-VP2蛋白二级结构进行预测,α-螺旋占12.50％,β-折叠区域占27.34％,无规则卷曲占60.16％;三级结构存在多个螺旋和折叠区域,主要以无规则卷曲为主.本研究结果为EMCV临床样本的快速筛检提供技术支持,同时EMCV-HB10-VP2蛋白的生物信息学分析为EMCV分子诊断试剂及基因工程疫苗研究等提供参考.
兽医学 脑心肌炎病毒 检测方法 聚合酶链式反应 VP2基因 编码蛋白
罗亚坤 王静 史利军 梁琳 蔺文成 崔尚金
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193
国内会议
北京
中文
130-141
2015-08-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）