CD326+A549细胞中LncRNA/mRNA/miRNA的芯片表达谱分析
方法:运用微阵列芯片技术研究CD326+的A549细胞中LncRNA/mRNA/miRNA的表达谱差异,探讨LncRNA/mRNA/miRNA与肺癌的关系.应用Gene Ontology(GO)categories和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes(KEGG)通路富集分析鉴定不同表达的LncRNA/mRNA/miRNA与肺癌相关通路的主要功能. 结果:结果显示,与CD326-A549细胞相比,CD326+A549细胞中LncRNA表达谱发生改变的共有1081个,其中表达上调的LncRNA有674个,表达下调的LncRNA有407个;mRNA表达谱发生改变的共有1035个,其中表达上调的mRNA有975个,表达下调的mRNA有60个;miRNA表达谱发生改变的共有358个,其中表达上调的miRNA有207个,表达下调的miRNA有151个.GO分类分析和KEGG通路富集分析及交互网络分析结果显示,不同表达的mRNA与肺癌的发生发展相关. 结论:因此,研究结果为进一步在肺癌中研究LncRNA/mRNA/miRNA的生物学功能提供线索.
肺癌 发病机制 LncRNA基因 mRNA基因 miRNA基因 微阵列芯片
张艳秋 申娴 隋静 李成云 姚文卓 洪伟伟 彭慧 梁戈玉
东南大学公共卫生学院,环境医学工程教育部重点实验室,江苏210009
国内会议
上海
中文
330-334
2015-11-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）