长散布核元件LINE-1去甲基化检测肝癌风险的meta分析
目的:评估长散布核元件(long interspersed nuclear element type1,LINE-1)去甲基化水平作为各种肝癌风险检测指标的有效性. 方法:通过检索pubmed、embase、web of science和cochrane数据库,使用stata12.0软件和随机效应模型对肝癌样本的LINE-1去甲基化水平进行评估,使用亚组分析异质性. 结果:共有7项研究2135例样本纳入研究,在肝癌样本中LINE-1的去甲基化水平显著高于对照的样本(SMD:3.215,95%CI:1.741,4.689;P=0).401例组织和1734例血液样本研究分别显示LINE-1的去甲基化水平存在差异(SMD:5.503;95%CI:2.309,8.696;p=0和SMD:0.984;95%CI:-0.265,2.234;p=0),其中,血液样本间存在显著性差异.COBRA法和Pyrosequencing法研究分别显示LINE-1的去甲基化水平存在差异(SMD:1.269;95%CI:0.845,1.694;p=0.247和SMD:5.297;95%CI:1.697,8.896;p=0),其中,Pyrosequencing法检测存在显著性差异. 结论:研究仅分析了样本来源和检测方法与肝癌基因组中LINE-1去甲基化变化的情况,为不同来源肝癌和不同方法检测LINE-1甲基化提供了新的证据,提示了不同来源肝癌的甲基化分析可能需要不同的检测方法.
肝癌 长散布核元件 甲基化水平 致病风险
侯志伟 李仁燕 马明福 李练兵 黄天华
国家卫生计生委出生缺陷与生殖健康重点实验室(重庆市人口和计划生育科学技术研究院),重198庆,4000202 汕头大学医学院生殖医学研究中心,广东汕头,515041
国内会议
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197-207
2015-04-24(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)