3种基因启动子甲基化联合端粒损伤构建肺癌筛查支持向量机模型
目的：探讨由外周血白细胞DNA中FHIT、RASSF1A和p16基因启动子甲基化水平以及DNA相对端粒长度4项生物标志建立的支持向量机模型在肺癌诊断中的意义. 方法：通过实时甲基化特异性PCR(Real-time methylationspecific PCR)法,测定200例正常对照和200例肺癌患者外周血白细胞DNA中p16、RASSF1A和FHIT基因启动子甲基化水平,实时荧光定量PCR方法测定外周血DNA相对端粒长度,基于上述4种生物标志构建肺癌诊断支持向量机模型. 结果：肺癌组和对照组中FHIT、RASSF1A和p16基因启动子甲基化水平分别为3.33(1.86～6.40)和2.85(1.39～5.44)(P=0.002),27.62(9.09～52.86)和17.17(3.86～50.87)(P=0.038),0.59(0.16～4.50)和0.36(0.06～4.00)(P=0.008),端粒相对长度分别为0.93±0.32和1.16±0.57(P＜0.001),这4项生物标志在两组间差异有统计学意义.基于4项生物标志建立的判别分析和支持向量机模型对预测集的的ROC曲线下面积(AUC)及95％CI分别为0.670(0.569～0.761)和0.810(0.719～0.882). 结论：成功构建基于p16、RASSF1A、FHIT基因启动子甲基化和端粒损伤4种生物标志的肺癌诊断支持向量机模型.
肺癌 病理诊断 基因启动子 甲基化水平 端粒损伤 支持向量机模型
冯晓蕾 段晓冉 王团伟 谭善娟 吴逸明 王威 吴拥军
郑州大学公共卫生学院劳动卫生与毒理学教研室 郑州 450001
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2015-04-24（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）