六个转录组分析厚壁毛竹的笋芽生长发育
厚壁毛竹(Phyllostachys edulis”Pachyloen”)是毛竹多个变异类型中唯一一个有用材价值的优良新品种,但其分子遗传机制并不为人所知.利用第二代高通量测序技术从霜降节气开始,对从霜降、大寒、冬至、雨水、春分、谷雨6个节气采集的厚壁毛竹笋芽分别进行转录组测序,共捕获30555个基因,基因平均覆盖率79%.将不同节气的竹笋的转录组进行两两比较,首次证实厚壁毛竹笋在不同节气基因表达有差异,其差异表达基因数从2288个到12991个不等,进一步将这些差异表达基因进行了GO功能注释和KEGG Pathway富集性分析,并初步报道了DNA复制、类胡萝卜素生物合成、淀粉和蔗糖代谢3个代谢通路的基因表达模式,在一定程度上解析了厚壁毛竹“竹壁特厚”等种质性状的分子调控模式及其机制.
厚壁毛竹 笋芽生长 基因表达 种质性状 分子调控
张莹 田埂 路慧萍 冉洪 胡陶 郭起荣
国际竹藤中心国家林业局竹藤科学与技术重点开放实验室 北京 100102 基因测序与合成平台清华大学生命科学学院 北京 100084
国内会议
湖南桃江
中文
117-124
2015-10-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)