成都市2010~2014年肠道病毒71型进化与变异分析
目的：对成都市2010～2014年肠道病毒71型进行进化与变异分析,探索其基因变异与进化规律,为手足口病的防控提供依据. 方法：选取2010～2014年荧光PCR检测EV71阳性标本,病毒分离后以一代或二代测序技术进行VP1或全序测定,所得序列构建进化树并进行相关生物信息学分析. 结果：31株病毒VP1基因含175个变异位点,基因同源性为80.36％～100％;氨基酸变异位点12个,同源性99.95％.上述标本基因亚型与阜阳株较为接近,均为C4亚型.2株毒株VP1可能存在基因突变,其中3位点与SNP位点一致. 结论：成都市2010～2014肠道病毒71型基因亚型变异不明显,但需关注VP1变异和SNP位点及其可能带来的防控挑战.
肠道病毒71型 基因变异 进化规律
陈恒 速丽媛 左浩江 杨才彬 黄韦唯 张晓春 陈振华 黄薇 孟建彤 栾荣生
成都市疾病预防控制中心;四川大学华西公共卫生学院 成都市疾病预防控制中心 四川大学华西公共卫生学院
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1-11
2015-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）