正红菇菌根际土壤细菌多样性

摘要：

本实验以正红菇(Russula griseocarnosa)菌根际土壤为研究对象,通过提取土壤微生物基因组DNA,以通用引物扩增细菌16S rRNA基因V6+V8区,将PCR产物进行变性梯度凝胶电泳(Denaturing Gradient Gel Electrophoresis),获得土壤微生物群落的DNA特征指纹图谱,并对图谱中的优势条带回收测序,通过Blast进行同源性比对并构建系统发育树,进而分析正红菇菌根际细菌群落组成及多样性.同源性比对结果表明,回收测序的15条DGGE条带分别归属于7个细菌类群:α-变形菌门(Alphaproteobacteria)、β-变形菌门(Betaproteobacteria)、γ-变形菌门(Gammaproteobacteria)、酸杆菌门(Acidobateria)浮霉菌门(Planctomycetes)、疣微菌门(Verrucomicrobia)及分类地位未知的不可培养细菌.在15条序列中有7条分别与变形细菌的α、β和γ-Proteobacteria相似,有5条与酸杆菌门相似,有3条分别与浮霉菌门、疣微菌门及分类地位未知的不可培养细菌相似.

关键词： 正红菇 外生菌根 根际土壤 细菌多样性

作者: 肖冬来 陈丽华 陈宇航 杨菁

作者单位: 福建省农业科学院食用菌研究所,福州 350003;特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心,福建福州350014 福建省农业科学院中心实验室,福州350003

会议类型: 国内会议

会议名称: 福建省科协第十四届学术年会分会暨2014年福建省食用菌学会学术年会

会议地点: 福建武夷山

会议语种:中文

页码: 66-72

在线出版日期: 2014-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）