芍药肌动蛋白基因的克隆及表达分析
肌动蛋白基因表达量大且基本恒定,因此常作为功能基因转录表达分析的内标基因.根据GenBank报道的芍药近缘物种Actin基因cDNA序列设计PCR扩增引物,用改良的CTAB-LiCl法提取”桃花飞雪”芍药花瓣总RNA,反转录后应用RT-PCR、技术成功扩增出了芍药Actin基因PCR产物,TA法克隆了芍药Actin基因,测序结果表明芍药Actin基因全长1134bp,共编码377个氨基酸,GenBank登录号为JX310002.芍药肌动蛋白在氨基酸水平上与棉花、向日葵、白梨等物种的肌动蛋白的同源性均达99％;BlastP分析表明芍药肌动蛋白隶属于NBD_sugar-kinase_HSP70_actin蛋白超级家族,存在3种肌动蛋白特征信号序列,基于同源模建预测的3D结构中含有4个结构域;生物信息学软件预测芍药肌动蛋白的分子量为41.7kD,等电点(pⅠ)为5.31,是一个定位于胞液、不合跨膜域、不合信号肽分子的亲水的、稳定蛋白.应用半定量RT-PCR技术分析了Actin基因在芍药不同组织及不同发育期内的表达情况,结果表明Actin基因在芍药根、茎、叶、花等组织中及芍药切花不同衰老期内的表达量保持恒定,表明Actin基因可以作为芍药功能基因表达分析的内标基因.
芍药 肌动蛋白 基因表达
李芳 范丙友 高水平 张文婷 史国安
河南科技大学农学院,洛阳市牡丹生物学重点实验室,河南洛阳471003 河南科技大学林学院,河南洛阳471003
国内会议
洛阳
中文
61-71
2013-04-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）