不同钾水平下花魔芋差异表达基因分析
为了探索魔芋对不同水平钾素营养的反应机制,提取施用低、中、高水平硫酸钾后5d的富源花魔芋叶片总RNA,合成了cDNA,采用优化的cDNA-SRAP技术体系分析了在低钾、中钾、高钾水平下富源花魔芋叶片的差异表达基因,并对其进行了生物信息学分析.结果显示:29对引物组合共扩增出507条基因片段,其中差异片段126条.相对于中钾处理,低钾、高钾处理的差异片段包括抑制型表达片段19条,诱导型表达片段14条,上调表达型片段29条,下调表达型片段64条.选取表达量高的13条差异片段进行回收测序,在NCBI上进行BLAST比对,共比对出9条差异片段的同源序列,其中4条与已知功能基因(谷氨酰胺酰-tRNA合成酶、β-ATP合成酶、GTP结合蛋白、核苷酸还原酶)有较高同源性,5条与假定基因或预测基因同源性较高,剩余序列未找到同源序列,可能是一些新的魔芋与钾营养吸收利用相关的基因,具体功能还有待于进一步研究.
花魔芋 基因表达 差异化特征 钾水平
曾黎琼 韩蓉蓉 段玉云 陈玲 文亦芾 李娥贤 姜飞
云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室 云南昆明650223 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室 云南昆明650223;云南农业大学动物科学技术学院 云南昆明 650201;西南大学 云南农业大学动物科学技术学院 云南昆明 650201 云南省农业科学院生物技术与种质资源研究所/云南省农业生物技术重点实验室/农业部西南作物基因资源与种质创制重点实验室 云南昆明650223;云南农业大学动物科学技术学院 云南昆明 650201
国内会议
成都
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53-58
2016-09-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）