中国荷斯坦牛长链非编码RNA的鉴定

摘要：

本研究首次对中国荷斯坦牛乳腺组织进行lncRNA研究，以期望鉴定到新的lncRNA为奶牛分子育种提供新的思路，寻找新的突破点。本研究鉴定到的781个lncRNA很大比例来自于基因间的lncRNA（lincRNA），与Shancheng Ren等人报道的相符。鉴定到的lncRNA有553个lncRNA属于新的lncRNA，这些新的lncRNA可以更好的补充NONCODE数据库。对lncRNA的统计分析发现lncRNA的长度和外显子个数要明显少于mRNA，外显子个数少是导致lncRNA整个片段长度小于mRNA的主要原因。lncRNA的开放式阅读框小于mRNA，这可能导致了lncRNA整体表达量较低。就保守性分析lncRNA的保守型低于mRNA。Tingting Li等人在鸡的骨骼肌中发现lncRNA保守型要低于mRNA，但是要显著高于基因组随机片段。因此lncRNA可能与mRNA有相似功能在机体中发挥重要作用。大多数lncRNA在6个样中均有所表达，说明lncRNA存在普遍性表达，能够稳定的在机体中发挥作用。XLOC_020887的lncRNA在样本中有较高的表达量，这些lncRNA在机体中可能发挥重要作用。

关键词： 奶牛 乳腺组织 长链非编码RNA 基因表达

作者: 蔡文涛 李聪 张胜利

作者单位: 中国农业大学动物科技学院,农业部畜禽遗传育种与繁殖重点实验室,畜禽育种国家工程实验室,北京 100193

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国畜牧兽医学会养牛学分会第八届全国会员代表大会暨2015年学术研讨会

会议地点: 北京

会议语种:中文

页码: 21-24

在线出版日期: 2015-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）