西门塔尔牛瘤胃木聚糖酶基因的克隆及相关序列的分析

摘要：

利用多种PCR技术从西门塔尔牛瘤胃微生物宏基因组内直接克隆出一种木聚糖酶基因Rua11A,并利用生物信息学软件对该基因序列和及其编码氨基酸序列进行预测和分析,序列分析结果表明:Rua11A全长1278bp,包括762bp的木聚糖酶编码区、102bp的连接肽编码区和411bp的碳水化合物结合域编码区,共编码425个氨基酸.Rua11A的氨基酸序列中包含31个氨基酸的信号肽及394个氨基酸的成熟肽;其成熟肽的理论分子量和等电点分别是43443.9Da和4.25;序列比对分析显示,Rua11A含有11家族木聚糖酶高度保守的氨基酸片段及催化活性中心,且与瘤胃中两种已知的11家族木聚糖酶的同源性分别为78％和56％;其木聚糖酶预测的空间结构具有11家族木聚糖酶的典型特征,即由2个β-折叠片和1个短的α-螺旋组成的“右手”型结构,表明Rua11A木聚糖酶属于11家族木聚糖酶.比对结果还显示Rua11A中的底物结合域隶属于碳水化合物结合域第四家族.

关键词： 牛 瘤胃微生物 宏基因组 木聚糖酶 基因克隆 序列分析

作者: 樊永亮 李瑞瑶 张慧敏 张成龙 杨章平 亏开兴 黄必志 王安奎

作者单位: 扬州大学,动物科学与技术学院,江苏扬州,225000 云南草地动物研究院,云南昆明,650000

会议类型: 国内会议

会议名称: 中国畜牧兽医学会养牛学分会第八届全国会员代表大会暨2015年学术研讨会

会议地点: 北京

会议语种:中文

页码: 43-47

在线出版日期: 2015-04-25（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）