猪体尺性状全基因组关联分析
本研究采用GRAMMAR-GC(Genome-wide Rapid Association using the Mixed Modeland Regression-Genomic Control)方法,使用DMU软件和R语言环境下的GenABEL软件包对猪腹围、体高、体长、胸深、胸宽、管围、臀围、臀宽、肩胛宽、腰宽等10个指标进行了GWAS分析,以寻找与体尺性状相关的遗传变异.结果共找到在全基因组范围内与体尺性状达到基因组水平显著的SNPs位点138个.其中体高、体长、管围、胸深和臀围等5个指标检测到了显著相关的SNP位点,分别有90、115、116、1和32个.对于显著的SNPs位点,根据芯片提供的探针序列,与Ensembl网站上猪基因组草图进行比对,确定了其物理位置,并在该区段内根据位置和功能筛选候选基因,借助生物信息学手段分析其功能.
猪 体尺性状 全基因组关联
王立刚 张龙超 颜华 刘欣 梁晶 张跃博 施辉毕 蒲蕾 张恬 赵克斌 王立贤
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京,100193
国内会议
武汉
中文
503-507
2014-06-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）