鹌鹑首例小分子RNA测序图谱
非编码小分子RNA(ncRNAs)几乎存在于所有较高等的真核生物细胞中,对生物体具有非常重要的调控作用.各种调控小分子RNA图谱的构建可以促进ncRNAs调控网络的完善及RNA生物学的发展.本研究着重分析了鹤鹑睾丸组织中内源性miRNAs和piRNAs这两类小分子RNA的分布特点与遗传特性。利用Solexa深度测序技术首次对性成熟鹌鹑睾丸组织中的小分子RNA序列进行深度测定,总共获得了11350876条序列读数.通过与Sanger miRNA数据库(miRBase 14.0)和鸡基因组(Gallus gallus v.2.1)的比对分析,本研究共检测到475个已知脊椎动物pre-miRNAs,编码239个成熟miRNAs,并预测了1109个禽类特异性的miRNAs序列.根据piRNA的特征,本研究还检测到长度为26~28nt的序列簇3531个,29~30nt的序列簇619个,并保留5′端为T的序列.
非编码小分子核糖核苷酸 基因序列 分布特点 遗传特性
常国斌 陈蓉 张颖 戴爱琴 马腾 徐琪 陈国宏
扬州大学动物科学与技术学院,江苏扬州 225009
国内会议
广州
中文
264-270
2011-11-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)