茶花鸡MHC B-G座位多态性与生物信息学分析
本研究利用PCR和测序技术获得茶花鸡MHC B-G基因全序列,分析其序列多态性,并预测其蛋白质的结构与功能.利用PCR和测序技术获得茶花鸡MHC B-G基因全序列,并利用生物信息学预测其蛋白质结构与功能.获得茶花鸡MHC B-G基因6119bp全序列,与红色原鸡同源性达94％,2个鸡种存在283个变异位点,均为单一多态位点,共缺失615 bp.核苷酸多样度(Pi)为0.0464,平均核苷酸差异(K)为283.00.茶花鸡和红色原鸡MHC B-G蛋白的二级结构以无规则卷曲和延伸链为主,并具有明显的跨膜螺旋结构,疏水性、柔韧性、表面可能性及抗原性预测结果显示,该蛋白具有丰富的B细胞抗原位点,分别含有108个和85个磷酸化位点.MHC B-G蛋白在2个鸡种中功能有相似之处,但也有一定的差异,茶花鸡和红色原鸡MHC B-G蛋白均主要有运输与合成的功能,但茶花鸡还主要承担免疫反应.茶花鸡MHC B-G基因具有较高的多态性,其可能对其进化、抗原递呈作用以及疾病和生产性能的相关性发生重要影响.
茶花鸡 主要组织相容性复合体 B-G基因 生物信息学
屠云洁 苏一军 张学余 李国辉 殷建玫
中国农业科学院家禽研究所,江苏扬州 225003
国内会议
珠海
中文
221-228
2011-10-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）