基于生物信息学的途径研究阿托伐他汀钙与其他药物的相互作用
近年,基因表达谱芯片作为高通量的基因表达检测方法在药物作用的研究中已较为常用,利用其高通量、高灵敏度的特点,结合生物信息学方法,应用多种芯片分析软件,深度挖掘芯片数据,探索药物的作用通路,减少盲目性研究。本实验应用Affymetrix U133A plus 2.0芯片,对阿托伐他汀钙干预后的EA.hy926细胞全基因表达谱进行研究。通过SAM软件筛选出差异表达基因,应用GSEA进行基因富集通路分析,结果显示阿托伐他汀对细胞周期调控、有丝分裂、微管结构的形成等113条下调基因通路及凝血机制、抗炎反应等13条上调基因通路的影响有统计学意义(P<0.01),在随后的Cmap分析中,筛选到的药物与GSEA分析结果相吻合:如MS-275,trichostatinA和vorinostat等组蛋白去乙酰化酶抑制剂是一类重要的细胞周期阻滞药物,而白藜芦醇的抗氧化作用也与阿托伐他汀的抗炎、抗氧化作用一致。而且结果与另一项根据化学结构进行的计算机模拟推测加实验研究结果一致,他汀的按酸盐部分可能直接与HDAC2的催化部位发生作用,进而抑制HDAC2的活性,发挥类似组蛋白去乙酰化酶抑制剂的作用。这也证实了研究方法的可靠性。通过这项研究发现,阿托伐他汀钙与组蛋白去乙酰化酶抑制剂、白藜芦醇及吩噻嗪类衍生物如硫利达嗪、丙氯拉嗪、三氟拉嗪等抗精神病药物基因表达谱上有很强的相似性,提示阿托伐他汀可能与这些药物有协同作用,这种协同作用对临床应用的影响值得进一步研究。
阿托伐他汀钙 药理作用 基因通路 调控机制 生物信息学
高燕 赵霞 裴晶 范利 曹剑 刘先锋 马聪 产学春
济南军区总医院干三科 解放军总医院南楼心一科 解放军总医院南楼血液科
国内会议
长沙
中文
140-143
2012-07-06(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)