基于基因组学对肺炎克雷伯噬菌体安全性的评估
多重耐药和泛耐药肺炎克雷伯菌的流行,使得对于该类菌引起的感染的治疗面临无药可用,近年来报道了越来越多的肺炎克雷伯菌噬菌体,并在动物模型中证明了噬菌体用于防控该类菌感染的有效性。然而,噬菌体作为病毒的一类,不同于传统的抗菌药物,在临床应用之前需要进行更为全面的评估。本研究就目前已报道肺炎克雷伯菌噬菌体从基因组水平对其进行研究,通过生物信息学方法评估其基因组稳定性,是否携带有害基因,是否属于溶原性噬菌体等方面进行分析研究。目前已报道22株肺炎克雷伯菌噬菌体的全基因组,7株属于肌尾科,12株属于短尾科,3株属于长尾科;而本研究基于噬菌体全基因组同源性分析结果将肌尾科和长尾科归为一类,定义为Kp_PhageI;短尾科分为Kp_phageIIa和Kp_PhageIIb两类。噬菌体基因组上含有肺炎克雷伯菌限制性内切酶不等数目的识别位点,不携带有毒力基因和耐药基因。5株属于温和噬菌体,15株属于烈性噬菌体。研究显示肺炎克雷伯菌噬菌体在基因组水平具有良好的安全性,但是基因组上较多的肺炎克雷伯菌限制性内切酶识别位点,使其用于抗菌治疗应用范围可能较窄。基于基因组同源性分析可将肌尾科和长尾科噬菌体归为一类,而短尾科噬菌体分为两类。在使用噬菌体用于防控细菌感染时部分温和噬菌体需要谨慎排除。
肺炎克雷伯菌体 安全性 生物信息学 基因组学
崔泽林 郭晓奎 汤荣 陈雯静 俞琦 洪庆 李莉
上海交通大学附属上海市第一人民医院检验医学科,200080 上海交通大学医学院基础部免疫学与微生物学系,200025
国内会议
贵阳
中文
81-87
2016-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）