Agilent表达谱芯片筛查RA患者成纤维样滑膜细胞差异表达基因
目的:用基因表达谱芯片筛选类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)患者关节成纤维滑膜细胞(fibroblast-likesynoviocytes,RA-FLSs)中差异表达基因,探索其与RA发病机制的关系。 方法:原代培养手术切取的膝关节滑膜组织中FLSs至第3代,用Agilent人基因表达谱芯片对3例RA患者和3例外伤患者的FLSs进行基因初筛,并对差异表达基因进行基因本体(gene ontology)和信号通路(pathway)分析。随后用实时定量PCR在15例RA-FLSs和15例外伤病人FLSs(CON-FLSs)中验证可能与RA发病机制有关的差异表达基因。 结果:与CON-FLSs相比,RA-FLSs共检出103个差异表达的基因转录本(差异倍数>2,P<0.05),其中36个表达上调,67个表达下调。定量PCR结果显示,与CON-FLSs相比,RA-FLSs中速激肽前体1α型(TAC1)、wnt诱导分泌蛋白3(WISP3)、血管内皮生长因子(VEGFA)基因上调,肿瘤坏死因子超家族成员15基因(TNFSF15)下调。 结论:TAC1、WISP3、VEGFA和TNFSF15基因在RA-FLSs中异常表达,探讨这些基因功能将有助于深入研究RA致病机制。
类风湿关节炎 发病机制 成纤维样滑膜细胞 基因表达谱芯片
张宇 王海永 管晓龙 李玲慧 王菲 赵琴飞 李晓军
南京军区南京总医院中心实验科,南京 210002
国内会议
贵阳
中文
445-452
2016-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）