17油桐β-酮脂酰-CoA合成酶(KCS)基因的克隆与序列分析
以油桐种子为材料,根据油桐转录组测序分析结果设计引物,利用RT-PCR技术克隆获得了1条KCS基因的全长cDNA,命名为Vf_KCS.生物信息学分析结果表明,KCS基因的CDS长度为1338bp,编码446个氨基酸;该基因编码的蛋白质具有3个酶活性位点、6个产物结合位点、5个丙二酰-CoA结合位点和多个二聚体形成位点;Vf_KCS有2个明显的跨膜螺旋拓扑结构和3个疑似跨膜螺旋拓扑结构;二级结构主要由α-螺旋、β-折叠和不规则卷曲构成,该蛋白为亲水性蛋白;Vf_KCS编码的氨基酸序列与其它物种的KCS氨基酸序列具有较高的相似性,其中与葡萄的KCS基因相似度最高达89.69％,与其他植物的KCS基因所编码的氨基酸同源性大多在80％以上;通过进化树分析表明Vf_KCS与拟南芥亲缘关系最为接近.综合各项生物信息分析结果表明本研究得到一个完整的油桐KCS基因,其功能有待进一步验证.
油桐 β-酮脂酰 CoA合成酶 基因克隆 序列分析 生物信息学
刘美兰 谭晓风 龙洪旭 周俊琴
湖南省长沙市经济林育种与栽培国家林业局重点实验室(中南林业科技大学),410004
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2013-09-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）