De novo Illumina技术在糖品腐败乳杆菌生物信息库建立中的应用

摘要：

本文应用De novo Illumina技术对一种未经测序的糖品腐败乳杆菌进行生物信息库的建立,包括全基因组遗传信息的首次获取以及基因功能的生物信息学分析与注释.通过对1株糖品腐败乳杆菌基因组DNA进行提取与纯化,构建符合质量要求的测序文库进行De novo Illumina测序,通过对De novo测序数据进行筛选与质量评价,进一步对筛选后的数据进行De novo组装与结果评价,最后获得乳杆菌全基因组序列;在获得全基因组序列的基础上,对全基因组序列进行基因预测,并对预测基因进行GO基因功能注释、COG基因功能注释与KEGG生物通路注释,获取该乳杆菌的基因序列与基因功能信息,为该乳杆菌功能基因的研究与生物信息学分析提供基础数据和技术参考,并进一步为糖品质量安全控制提供理论基础和科学依据.

关键词： 糖品腐败乳杆菌 De novo Illumina技术 生物信息库 全基因组信息 基因功能注释

作者: 刘君彦 李琳 李冰 邓阳 徐振波

作者单位: 华南理工大学,轻工与食品学院,广州510640 华南理工大学,轻工与食品学院,广州510640;美国马里兰大学微生物病理系,巴尔的摩MD21201

会议类型: 国内会议

会议名称: 第二届糖业科技与发展高峰论坛

会议地点: 广州

会议语种:中文

页码: 435-450

在线出版日期: 2015-07-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）