基于二代测序技术的浙江省地方猪种的分子遗传聚类
文中试验选取了金华猪、嵊县花猪、嘉兴黑猪、兰溪花猪、岔路黑猪、碧湖猪、淳安花猪等7个浙江省地方猪种和大白、长白、杜洛克3个外来猪种共491头,采用第二代测序技术,得到SNP座位53860个,并使用最大似然法计算遗传距离,结果表明:7个浙江省地方猪种之间的平均遗传距离为1.073,3个外来猪种之间的平均遗传距离为0.60,金华猪与长白猪之间的遗传距离最远,为2.031.构建的N-J系统进化树表明3个外来猪种首先归为一类,淳安花猪和嘉兴黑猪也较早归为一类,而岔路黑猪、金华猪和嵊县花猪相对其他猪种较远.这一研究结果为浙江省地方猪种的种质特性和进一步的开发利用提供了参考.
地方猪种 第二代测序技术 遗传距离 聚类分析 种质特性
陈究成 毛海光 徐宁迎 潘玉春 章学东
浙江大学动物科学学院遗传育种实验室,浙江杭州310058 上海交通大学农业与生物学院,上海200240 杭州市农业科学院畜牧所,浙江杭州310024
国内会议
北京
中文
57-60
2015-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）