秦川牛增强子结合蛋白(C/EBP)基因的克隆、组织表达谱和序列特征分析
目的：克隆秦川牛增强子结合蛋白(C/EBP)基因的CDS序列,并进行组织表达谱和蛋白质结构分析,为肉牛的分子育种提供理论基础.方法：以比较基因组学为基础,采用RT-PCR和PCR方法获得了C/EBP基因的CDS序列;并采用Real-time PCR方法分析C/EBP基因在秦川牛15个组织中的表达;通过生物信息学方法预测了牛C/EBP基因的蛋白结构.结果：秦川牛C/EBP基因的CDS全长1062bp(e)在所检测的15个组织中,C/EBP基因mRNA均有表达,在脂肪组织中的表达明显高于其它组织.C/EBP无明显的信号肽,在第233～252氨基酸区域有明显的跨膜区域.蛋自二级结构主要由螺旋、无规则卷曲和少量直链延伸组成.结论：本研究成功克隆秦川牛(C/EBP)基因完整的CDS区域;获知在第277～340位的螺旋组成了亮氨酸拉链(bZIP)结构.秦川牛C/EBP基因编码的氨基酸序列与野猪、人、褐家鼠、兔、小家鼠的氨基酸序列同源性分别为97％,95％,94％,94％,93％,表明在进化关系上,C/EBP氨基酸序列具有很好的保守性.
秦川牛 增强子结合蛋白 基因克隆 组织表达谱 基因序列
王虹 昝林森 成功 王洪宝 宋付标
西北农林科技大学,动物科技学院,中国,陕西杨凌,712100 西北农林科技大学,动物科技学院,中国,陕西杨凌,712100;国家肉牛改良中心,中国,陕西杨凌,712100
国内会议
陕西杨凌
中文
191-199
2011-05-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）