绵羊肺腺瘤病毒NM株囊膜蛋白B细胞抗原表位预测
为了制备用于双抗体夹心ELISA方法检测绵羊肺腺瘤病(OPA)的特异性和高效价的多克隆抗体.参照本实验室上传到Genbank中的绵羊肺腺瘤病毒NM株env基因序列,登录号(JQ837489),利用DNAStar软件分析推导的氨基酸序列,与绵羊肺腺瘤病毒代表株JSRV21(AF105220)和JSRVJS7(AF357971.1)的囊膜蛋白氨基酸序列比较同源性均为99.5％.JSRV21和JSRVJS7的囊膜蛋白氨基酸序列同源性为99.8％.应用Gamier-Robson方法、Chou-Fasman方法预测绵羊肺腺瘤病毒NM株囊膜蛋白的二级结构.用Kyte-Doolittle方法预测蛋白质的疏水区和亲水区，用Emini方法预测特定区域位于蛋白质表面的可及性，以Jamson-Wolf方法预测蛋白的抗原指数，然后将亲水性、表面特性、柔韧性、二级结构四参数联合对预测的表位进行综合分析，再结合Bcepred，IEDB，ABCpred服务器对囊膜蛋白B细胞抗原表位预测结果，去掉α螺旋和β折叠区，预测的615个氨基酸的主要优势抗原表位分别是52-76aa 101-110 aa, 118-165 aa，182-196 aa, 201-215 aa, 240-264 aa, 268-275aa，281-305 aa，309-332 aa，335-356 aa，461-476 aa，502-512 aa，530-574 aa。分析结果表明囊膜蛋白具有多处抗原指数较高的区段，因此其在免疫学中的地位应当引起重视。生物信息学预测JSRV-env基因抗原表位，为寻找有价值的抗原靶点提供了参考，具有优势抗原表位的重组蛋白片段制备的抗体在绵羊肺腺瘤病诊断中具有潜在应用价值，可作为联合诊断的备选抗体。
绵羊 肺腺瘤病毒 囊膜蛋白 B细胞 抗原表位
刘月 张宇飞 张亚坤 孙晓林 刘淑英
内蒙古农业大学兽医学院,呼和浩特010018 农业部动物临床诊疗技术重点实验室,呼和浩特,010018
国内会议
2012年中国畜牧兽医学会兽医病理学分会暨中国病理生理学会动物病理生理专业委员会学术研讨会
北京
中文
84-84
2012-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）