基于NCBI公共数据平台的软枣猕猴桃EST-SSR开发
应用SSR Hunterl.3软件对中华猕猴桃EST数据库进行搜索,查找微卫星(Microsatellite)序列.利用检索出的SSR-EST序列设计并合成了150对EST-SSR引物.利用这些引物及已发表的20对中华猕猴桃EST-SSR引物分别在中华猕猴桃、美味猕猴桃及两个野生居群的软枣猕猴桃基因组DNA中进行PCR扩增,其中98、103、94和80对引物分别在平江中华猕猴桃、毛坝美味猕猴桃、山东和四川居群的软枣猕猴桃中存在有效扩张,可扩增率分别为57.6％,60.6％,55.3％和47％.80对引物在平江中华猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的47 ％;71对引物在毛坝美味猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的41.8 ％;60对引物在山东居群的软枣猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的35.3 ％;47对引物在四川居群的软枣猕猴桃中扩增出多态,占所用引物数的27.7％.结果表明,中华猕猴桃EST-SSR在软枣猕猴桃中具有较强的通用性,而不同地理位置的同物种居群多态性差异较大.本研究开发了数量较多、质量较好的软枣猕猴桃SSR,将为软枣猕猴桃居群遗传学、分子系统地理学研究以及分子育种提供有效工具.
软枣猕猴桃 简单重复序列位点 引物扩增 表达序列标签数据库
满玉萍 张蕾 覃瑞 王彦昌 李作洲 姜正旺 孙晓荣 刘长江
中国科学院武汉植物园 武汉430074;中南民族大学生命科学学院 武汉430074 中国科学院武汉植物园 武汉430074 中南民族大学生命科学学院 武汉430074 沈阳农业大学 沈阳110866
国内会议
成都
中文
278-283
2010-10-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）