植物病原细菌Harpin家族的特征
以16个植物病原细菌harpin蛋白为代表,采用生物信息学方法,对harpin蛋白家族的特征进行分析.利用软件Lasergene 7.0统计分析Harpin家族的理化特性;利用在线软件CLUSTAL2.0.12进行蛋白的序列比对.结果表明,Harpin蛋白家族的等电点在3.61～6.34之间,基因在402～1113 bp之间.富含甘氨酸,绝大多数甘氨酸的含量都在13％～25％之间,不含或含有少量的半胱氨酸.富含甘氨酸序列呈现特征性分布,序列GGG-GG(或者GG-GGG)不同程度地在部分harpin中出现.来源不同种群的harpin分别具备保守序列,黄单胞菌harpin的保守序列为QGISEKQLDQLL和ILQAQNGGG;欧氏杆菌的为GQFMDQYPE和PDDDGMT;丁香假单胞菌的为LIHEKLGDNFGASA.根据分析结果,进一步将Harpin家族划分为Hpa、HrpN和HrpZ3个组群.本研究对于进一步探讨harpin蛋白的结构和功能,更好地利用harpin蛋白及其基因防治植物病害,具有十分重要的意义.
植物病原细菌 过敏致病性蛋白 家族特征 生物信息学
张佳环
吉林农业大学农学院,分子植物病理实验室,长春130118
国内会议
厦门
中文
277-286
2010-07-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）