会议专题

棉花叶绿体基因组全序列微卫星分布规律研究

利用已公布的陆地棉(Gossypium hirsutum)叶绿体基因组全序列测序结果,应用生物信息学软件对其叶绿体微卫星(cpSSR)的分布规律进行了全面分析.结果发现,陆地棉叶绿体基因组上共有72个微卫星,主要分布于大单拷贝区和小单拷贝区,且以单碱基微卫星为主,占总数的76.4%;二碱基微卫星占总数的20.8%;三碱基微卫星占总数的2.8%.在单碱基微卫星中,又以A/T重复为主,二者共占单碱基微卫星的92.7%.单碱基微卫星的重复次数以10~12次为主,二碱基微卫星的重复次数以5~6次为主.本研究结果为开发棉属植物叶绿体通用引物提供了理论依据.

棉花 叶绿体微卫星 分布规律 生物信息学

蔡小彦 刘方 周忠丽 王星星 王春英 王玉红 王坤波

棉花生物学国家重点实验室/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳455000

国内会议

中国棉花学会2015年年会

新疆昌吉

中文

67-67

2015-08-09(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)