棉纤维断裂比强度SLAF-seq测序及关联分析
本研究以断裂比强度为主要研究性状，以断裂比强度低的棉花品系2311-2和断裂比强度高的棉花品系1498为亲本材料，构建F2分离群体，依据F2群体中断裂比强度的相对差异，选取断裂比强度大、小2个极端性状的个体分别建立基因混池。对棉花断裂比强度性状不同的2个亲本及其F2分离群体(2个极端混池)进行SLAF-seq测序，以异源四倍体棉花(Gossypium hirsutum L.)基因组序列为参考基因组，通过ED方法对多态性SLAF标签的分析，共关联到149个基因，获得性状关联区域共2.82Mb。使用BLAST软件关联区域内的候选基因分别与NR、SwissProt、KEGG、GO和COG数据库比对，进行功能注释和生物通路富集分析，本研究通过测序及关联分析获得与断裂比强度性状紧密相关的分子标记及候选关联基因，这为进一步深入挖掘高断裂比强度基因及其应用奠定基础。
棉花 纤维品质 断裂比强度 简化基因组深度测序技术 基因混池
唐丽媛 江振兴 张建宏 刘存敬 张素君 张香云
河北省农林科学院棉花研究所/农业部黄淮海半干旱区棉花生物学与遗传育种重点实验室/国家棉花改良中心河北分中心,石家庄050051 河北行政学院,石家庄050031
国内会议
新疆昌吉
中文
72-72
2015-08-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）