甘肃马鹿MyoG基因5′UTR单核苷酸多态性检测及其序列变异分析
为了初步探索肌细胞生成素(MyoG)基因在鹿科动物上的遗传多态性,试验采集56只甘肃马鹿的血液样品,采用PCR-SSCP和克隆测序的方法对MyoG基因(GenBank登录号:FJ746497)5′UTR部分序列进行了单核苷酸多态性(SNPs)检测及序列变异分析.结果表明:①引物P1的PCR扩增片段存在多态性,经克隆测序分析,在5′UTR-237 bp处存在G→A的转换变异,该位点表现为AA、AB和BB 3种基因型,由A和B2个等位基因控制;对基因型、等位基因频率及群体遗传多态性分析结果发现,AA基因型频率最高,A基因为优势等位基因,该位点多态信息含量(PIC=0.193)为低度多态(PIC＜0.25);经过TFSEARCH 1.3分析软件预测发现,该变异可能减少了1个Sp1转录因子.②引物2的PCR扩增片段检测到1个SNP多态位点(-46 bp,G→A),表现为CC、CD和DD 3种基因型,基因型频率分布为CC＞ DD＞ CD,该位点多态信息含量(PIC=0.266)为中度多态(0.25＜PIC＜0.5),但该变异并未引起潜在调控元件及蛋白质结合位点的改变.本研究结果为进一步分析MyoG基因SNPs位点与甘肃马鹿胴体、肉质性状的关联性奠定了基础.
马鹿 肌细胞生成素基因 单核苷酸多态性 转录因子
宋兴超 杨福合 邢秀梅 刘汇涛 岳志刚
中国农业科学院特产研究所 吉林省特种经济动物分子生物学省部共建实验室特种经济动物种质资源遗传改良重点开放实验室 吉林132109
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2010-08-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）