用特征功能模块法挖掘一个虚寒证家系的基因表达谱
目的:利用基因表达谱与基因功能知识识别虚寒证相关的差异基因与功能模块,从功能模块水平研究虚寒证发生的分子机理.方法:用Array Tools筛选差异表达基因,并检验分类效果,再利用Gene Ontology(基因本体,GO)工具,将特征基因进行功能注释,选择显著聚集差异表达基因的功能模块;识别其中能够有效分类疾病样本的特征功能模块,并分析它们与虚寒证的关联.结果:用25个差异基因分类样本准确率在93％,用11个功能模块分类样本准确率在86-100％之间.结论:这些特征功能模块与虚寒证的发生有一定的关联性.基于特征功能模块法研究基因表达谱更有利于对疾病的阐释.
虚寒证 基因表达谱 特征功能模块法 分子机理
杨丽萍 黄睿 张洛欣 王米渠 吴伟
河南中医学院生物化学与分子生物学学科 郑州 450008 新加坡国立大学数学系 成都中医药大学中医遗传学研究室 新加坡细胞分子生物学研究所
国内会议
成都
中文
359-362
2010-04-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）