代尔夫特菌MTQ3及其tetR缺失突变株的转录组分析

摘要：

为进一步阐明MTQ3拮抗的分子机制,本研究对MTQ3和MTQ3-ΔT进行了转录组测序,得到了6294个Unigene,通过在数据库中比对分析,得到了1428个差异显著的Unigene.将2个样品MTQ3和MTQ3-ΔT的序列信息同与其相似度较高的同属菌株Delftia acidovorans SPH-1和Delftia sp.Cs1-4的全基因组序列信息进行比对,进行1428个差异基因的定位,发现共有665个Unigenes在Delftia acidovorans SPH-1和Delftia sp.Cs 1-4比对中相似度均为100％,说明665个Unigenes在基因组中是比较保守的区域.根据在数据库中比对到的相关基因的功能注释,将差异显著的1428个Unigene进行了功能分类.在差显基因中发现了一些和NRPS合成相关的基因簇，并且，在Pathway的富集结果中发现MTQ3-△T的一些与CoA合成、氨基酸合成和脂肪酸合成相关基因普遍下调。所以，推测调控基因tetR直接或间接产生的拮抗物质可能为脂肤类抗生素，脂肤的肤骨架可能是经NRPS途径合成，相关基因的功能鉴定正在进一步研究中。

关键词： 代尔夫特菌 基因缺失 突变株 转录组分析

作者: 李娜 郭海萌 侯启会 汪城墙 刘凯 丁延芹 杜秉海

作者单位: 山东农业大学生命科学学院,山东省农业微生物重点实验室,山东泰安 271018

会议类型: 国内会议

会议名称: 第十二届全国土壤微生物学术研讨会暨第五届全国微生物肥料生产技术研讨会

会议地点: 武汉

会议语种:中文

页码: 116-116

在线出版日期: 2014-11-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）