基因组序列分析揭示我国存在甘蔗黄叶病毒新基因型

本文测定了来自我国广东的一个甘蔗黄叶病毒(Sugarcane yellow leaf virus,SCYLV)分离物chn1的近全长基因组序列.分析表明,所获得的序列长度(5803bp)覆盖了该病毒全基因组序列的98%以上,包含全部的6个开放阅读框和它们之间的非编码区.该分离物同古巴分离物CUB-YL1(CB86010)在病毒基因组ORF0,ORF1,ORF2序列上的同源性最高,但两者间核苷酸同一率(95.2%-97.4%)和推导氨基酸同一率(93.2%-97.2%)均低于已知各基因型之间的同一率.通过序列比对和构建系统进化树分析,结果均表明chn1代表了该病毒内的一个新基因型,建议将该新基因型命名为CHN1.
甘蔗 黄叶病毒 基因型 近全长基因组 序列分析
王明强 周国辉
华南农业大学资源环境学院植物病毒研究室,广东广州 510642
国内会议
海口
中文
149-154
2014-08-01(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)