基因组序列分析表明甘蔗条纹花叶病毒为马铃薯Y病毒科的一个新属成员
(0) 本文测定了甘蔗条纹花叶病毒(Sugarcane streak mosaic virus,SCSMV)巴基斯坦分离物(PAK)的全基因组序列,序列全长9782bp(未包括3’末端PolyA),包含一个编码3130氨基酸的多聚蛋白的大开放阅读框,推导的多聚蛋白很可能被9个公认的蛋白酶位点所分开而形成10个蛋白质.确定了该分离物同马铃薯Y病毒属内其它病毒相关位置同源蛋白的保守序列.基因组的结构同马铃薯Y病毒科内的甘薯病毒属、马铃薯Y病毒属、大麦黄化花叶病毒属、小麦条纹花叶病毒属几乎是一致的.序列分析表明在基因组序列上该分离物同甘蔗花叶病毒和高粱花叶病毒存在显著差异,虽然这3种病毒有相似的症状表现和寄主范围.以多聚蛋白核苷酸序列为分析基础,SCSMV-PAK同小麦花叶病毒的同源性为52.5％,同该科内已归属和未归属的病毒的同源性为26.4-31.5％.以多聚蛋白和推导的各个蛋白的氨基酸序列构建系统进化树分析表明,与马铃薯Y病毒科内其它属的病毒相比,SCSMV-PAK和小麦花叶病毒形成了一个独立的分支.因此,SCSMV应该为马铃薯Y病毒科内的一个新种,并与小麦花叶病毒构成一个新属,建议命名为甘蔗条纹花叶病毒属(Susmovirus).
甘蔗 条纹花叶病毒 全基因组 序列分析 马铃薯Y病毒科
许东林 周国辉 谢煜佳 Ray Mock Ruhui Li
美国农业部农业研究服务署,国家种质资源实验室,贝尔兹维尔,马里兰州,20705 植物病毒研究室,华南农业大学,广东广州 510642
国内会议
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166-176
2014-08-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）