吖啶酮衍生物8a的蛋白质组学研究
本研究基于二维纳升超高效液相色谱/质谱(2D-LC/MSMS)联用的分析方法,对化合物8a对CCRF-CEM人急性淋巴细胞白血病T淋巴细胞进行蛋白质表达水平层面的组学研究,研究发现:对照组和加药组共检测到1240个蛋白,鉴定到929个.通过R语言clusterProfiler对得到的蛋白进行功能富集分析，检测到三条KEGG的通路被富集，包括系统性红斑狼疮，致病性大肠杆菌感染和糖酵解/糖异生通路。采用gage (GenerallyApplicable Gene-set/Pathway Analysis)对得到的蛋白进行基因集的富集分析表明共有16条显著差异通路的基因集被共调节，其中主要包括蛋白-基因复合物组装，核小体组织和自组装生物大分子复合物亚族组织和染色质的自组装，涉及到的蛋白基本都是组蛋白。最后，采用western blot对涉及到糖酵解途径的三个关键限速酶进行验证，并得到吻合组学的结果，对磷酸化的组蛋白进行检测，发现8a可明显通过磷酸化组蛋白H2AX来导致DNA的断裂，并由DS软件模拟8a与DNA相互作用的结果。综上所述，基于nano-UPLC/Q-TOF MS的蛋白质组学手段对8a作用机理的研究提供了区别于传统生物学的新的思路。
吖啶酮衍生物 蛋白质组学 抗肿瘤效果 高效液相色谱 质谱分析
陈孝武 高丹 刘红霞 蒋宇扬
清华大学化学系,北京,100084;清华大学深圳研究生院广东省化学生物学重点实验室,深圳,518055 清华大学深圳研究生院广东省化学生物学重点实验室,深圳,518055
国内会议
威海
中文
170-171
2014-04-19（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）