基于树核的蛋白质相互作用关系提取的研究
蛋白质相互作用关系对理解生物过程具有非常重要的意义,基于特征向量的方法避免不了复杂的特征向量的构造和映射过程，因此目前的研究重点都转向了可以直接利用结构化信息的核方法上.为了解决同位语依存关系带来的噪音干扰,提出了一个改进的基于树核的PPI提取方法,通过定义一些相关的处理规则来有效优化两个蛋白质之间的最短依存路径,在此基础上,用有效优化路径来指导成分句法树的裁剪,使得用于PPI提取的成分树更加精确和简洁.实验结果表明:用有效优化路径指导的成分句法树在五个常用的语料库上都取得了较好的效果。
信息处理 蛋白质相互作用关系 噪音干扰现象 路径优化 树核理论 树核
刘念 马长林 张勇 王梦
华中师范大学计算机学院,湖北武汉430079
国内会议
武汉
中文
232-236
2013-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）